302
Εκδόσεις ΜΠΑΧΑΡΑΚΗ – Βιολογία Θετικών Σπουδών
παραλείπεται κάποιο νουκλεοτίδιο (συνεχής), καθώς κάθε νουκλεοτίδιο
ανήκει σε μία μόνο τριπλέτα (μη επικαλυπτόμενος).
Επίσης, στο συγκεκριμένο
τμήμα είναι γνωστός ο προσανατολισμός των αλυσίδων από την –
ΟΗ (3’
άκρο) της αλυσίδας Ι.
Συνεπώς η κωδική του αλυσίδα είναι η Ι
(
πάνω
)
αλυσίδα, με κατεύθυνση από
δεξιά προς τα αριστερά
(3
’
¬
5
’)
.
Αλυσίδα Ι
3’
GCCAATATTA AAT GAG CAT GCC GTA GGAATATTCGG
5’ κωδική
Αλυσίδα ΙΙ
5’
CGGTTATAAT TTA CTC GTA CGG CAT CCTTATAAGCC
3’
μη κωδική
Η
RNA
πολυμεράση προσδένεται στον υποκινητή με τη βοήθεια μεταγραφικών
παραγόντων και προσθέτει συμπληρωματικά ριβονουκλεοτίδια έναντι των
δεοξυριβονουκλεοτιδίων της μη κωδικής αλυσίδας ενώνοντάς τα με 3’ –
5’
φωσφοδιεστερικό δεσμό. Απέναντι από Α προσθέτει
U
, απέναντι από Τ
προσθέτει Α και απέναντι από
G
προσθέτει
C
και αντίστροφα.
Το
mRNA
συντίθεται με κατεύθυνση 5΄ → 3΄ με μεταγραφή της μη κωδικής
αλυσίδας με βάση τον κανόνα της συμπληρωματικότητας και της
αντιπαραλληλίας. Επομένως, το
mRNA
που προκύπτει από τη μεταγραφή της
μη κωδικής αλυσίδας φέρει την ακόλουθη αλληλουχία (μεταγράφεται
ολόκληρη η αλυσίδα ΙΙ)
:
mRNA
5΄
GGCUUAUAAGG
AUG
-CCG-UAC-GAG-
UAA
AUUAUAACCG
3΄
Δ4.
Η αλληλουχία που αναγνωρίζει η περιοριστική ενδονουκλεάση είναι η:
3΄
AATATT
5΄
5΄
TTATAA
3΄
Αυτό γιατί η περιοριστική ενδονουκλεάση θα πρέπει να κόψει εκατέρωθεν του
γονιδίου
ούτως ώστε να δημιουργήσει μονόκλωνα άκρα από αζευγάρωτες
βάσεις στα κομμένα άκρα και να μπορέσει έτσι το γονίδιο να εισαχθεί στο
πλασμίδιο, το οποίο θα κοπεί φυσικά με την ίδια περιοριστική
ενδονουκλεάση. Έτσι από τη στιγμή που παρατηρούμε ότι η συγκεκριμένη
αλληλουχία βρίσκεται τόσο αριστερά όσο και δεξιά στο γονίδιο, είναι αυτή
που θα αναγνωρίσει η περιοριστική ενδονουκλεάση δ, που επιλέχθηκε στο
ερώτημα Δ1
.
Δ5.
Η μεταγραφή ενός γονιδίου ξεκινά μετά την πρόσδεση της
RNA
πολυμεράσης
στον υποκινητή του γονιδίου, μια αλληλουχία στο δίκλωνο
DNA
που πρέπει να
προηγείται του γονιδίου. Επίσης, η μεταγραφή του γονιδίου σταματά στις
αλληλουχίες λήξης της μεταγραφής που ακολουθούν την αλληλουχία του
γονιδίου.